調べたところ、案の定、wp-content/themes/内のdefault themeにあるsidebar.phpが上書きされていた。WordPress V3.oに上げたときに、themeにも何か更新を加えているようだ。
　元通り、パッチを当てて、再びカウンターが現れるようになった。相変わらず、カウンターの少なさがバレバレ。